In una ciotola versate l'acqua, scioglietevi all'interno il lievito di birra e lo zucchero. Versatevi quindi le due farine e iniziate a mescolare per amalgamare gli ingredienti. Aggiungete anche l'olio evo. Quando l'impasto inizia a stare insieme, anche se ancora grumoso, aggiungete anche il sale e mescolate bene.
Spostatevi su un piano di legno infarinato e continuate a impastare, fino a ottenere un impasto liscio e morbido. Mettetelo quindi in una ciotola unta d'olio a lievitare, fino al raddoppio. Ci vorranno circa due ore.
Quando l'impasto avrà raddoppiato il suo volume, toglietelo dalla ciotola e versatelo su una teglia bella unta d'olio. Allargatelo con le dita, facendo una pausa di 10 minuti se vedete che l'impasto tende a ritirarsi, poi proseguite fino a che non avrete raggiunto i bordi. Rimettete quindi l'impasto steso a lievitare per un'altra ora, coperto con pellicola per alimenti.
Nel frattempo preparate il condimento: in una padella mettete a rosolare una cipolla pulita e tagliata a fette molto sottili. Lasciatela rosolare qualche minuto, poi aggiungetevi la passata di pomodoro. Fate cuocere 10 minuti, aggiustate di sale e pepe, spegnete il fuoco e mettete da parte a raffreddare.
Quando sarà passata un'ora, è tempo di condire la focaccia. Cospargete di salsa l'impasto, poi aggiungete olive taggiasche, capperi dissalati e strizzati (altrimenti risulteranno troppo salati), acciughe dissalate (o in alternativa filetti d'acciughe sott'olio), qualche spicchio d'aglio con la camicia (che andrà eliminato una volta cotta la sardenaira).
Condite con un filo d'olio evo, cospargete di origano e infornate in forno statico a 200° per 25-30 minuti. La Sardenaira deve risultare colorata in superficie, morbida, ma con una base ben cotta e croccante. Sfornatela, tagliate a quadri e servite calda o a temperatura ambiente.